① 在上海買房貸款首付比例
就您上述情況，
在上海只能限購1套，但夫妻雙方必須至少有一人社保或個稅，自購房之日前連續繳納滿5年及以上。
買房需要資料：借款人夫妻雙方戶口簿、身份證及復印件、與售房單位簽訂的購房合同或協議、借款人首期房款存款證明及復印件。個人住房貸款申請表（格式銀行提供）等。
首付比例：
在上海有一套房或無房屋但有住房貸款記錄的，購買普通住宅首付比例不低於50%，購買非普通住宅首付比例不低於70%。
所以，如果您已經有5年以上社保，就有購房資格，再您南京房子房貸還存在的情況下，您在上海買普通住房首付比例是不低於50%。
目前未還清南京那套房貸的前提下，您如果在上海買房估計只能用商業貸款，年後如賣掉南京房子，可以申請變更為公積金貸款。
具體執行政策有差異，以您意向購買房源的地區政策為主。
② 現在上海的購房貸款比例如何
在上海購房具有購房資質的前提下且無房無貸款記錄的算作首套，首付是總房款的3.5成；如果是二套，普通住宅是5成首付，非普通住宅是7成首付。
（根據上海普通住宅調整後的標准，普通住宅實際成交價格應低於同級別土地上住房平均交易價格1.44倍以下，內環線內、內外環線間、外環線外每套應分別低於450萬元、310萬元和230萬元。）但是目前基本上非常難找到普通住宅的新房，所以基本上二套7成首付。
③ 上海購房首付比例和貸款比例問題
上海買房首付是合同價的35%、50%、70%。其中35%是指您全國各地沒有任何房貸記錄。有過商品房貸款記錄，首付50%或者70%。普通住宅首付50%，非普通住宅首付70%。
首套房認定標准
1、貸款買過一套房，商業貸款已結清，再貸款買房——算首套。
2、貸款買過一套房，後來賣掉，通過房屋登記系統查詢不到房產，但在銀行徵信系統里能查到貸款記錄，再貸款買房——算首套。
3、 全款買過一套房，貸款買房——算首套。
4、全款買過一套房，後來賣掉了，房屋登記系統查不到房產，再貸款買房——算首套。
5、 個人名下有兩套房的商業貸款記錄，全都已還清且出售，同時能夠提供兩套住房出售的證明，這種情況下再貸款時——算首套。
6、個人名下有一套房商業貸款已還清，另一套是公積金貸款已出售，同時能夠提供住房出售的證明，申請商業貸款再買房——算首套。
7、夫妻兩人，一方婚前買房使用商業貸款，另一方婚前購房用的是公積金貸款，婚後兩人想要以夫妻名義共同貸款。若貸款已還清，銀行業金融機構可以根據借款人償付能力、信用狀況等具體因素靈活把握貸款利率和首付比例。
8、夫妻兩人，一方婚前有房但無貸款記錄，另一方婚前有貸款記錄但名下無房產，婚後買房申請貸款——算首套。
④ 在上海購房的首付比例是如何判定的
目前在上海購房的首付比例是按照首二套來區分的，若在上海地區名下無房且在全國范圍內無購房貸款記錄，則為首套需支付35%的首付比例，否則為二套，需支付70%的首付比例。